286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0298 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0298  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  806    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.343578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  30.97 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  27.38 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.41 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  27.66 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.1 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  26.41 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.39 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.32 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  25.43 
 
 		 359 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  26.04 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.38 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  25.68 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.11 
 
 		 331 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  25.16 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  27.62 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  26.73 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.43 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2431  ApbE-like lipoprotein  25.71 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  26.6 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2110  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.46 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0092  ApbE family lipoprotein  27.33 
 
 		 391 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.35 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.18 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  25.83 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  24.54 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  26 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  24.54 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  28.12 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.06 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.64 
 
 		 337 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  25.45 
 
 		 347 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.74 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  24.78 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.95 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  24.54 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.85 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  24.92 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  27.36 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  23.87 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  23.87 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  23.87 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  23.87 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  25.82 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.22 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  25.72 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2771  ApbE family lipoprotein  25.85 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  25.8 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  25.97 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  29.09 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.51 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  26.38 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  24.36 
 
 		 343 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.83 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3361  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.54 
 
 		 343 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.81 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.38 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.81 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  27.4 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  25.15 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.48 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.48 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.48 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.48 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.63 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  24.47 
 
 		 345 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  24.6 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  24.73 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.15 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  25.65 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  22.06 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  23.8 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.33 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.62 
 
 		 351 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.33 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.33 
 
 		 350 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.33 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  27.11 
 
 		 330 aa  93.2  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  26.12 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  26.67 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  25 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  27.43 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  23.57 
 
 		 336 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  24.74 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2105  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  26.01 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  23.49 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  24.64 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  23.7 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  25.35 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.39 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  25.45 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.7 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  26.16 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  27.75 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  24.34 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>