More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2609 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  70.37 
 
 
484 aa  678    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  71.95 
 
 
492 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
492 aa  978    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  73.42 
 
 
493 aa  704    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  68.52 
 
 
517 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  58.91 
 
 
500 aa  529  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  55.28 
 
 
490 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  50.51 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  49.9 
 
 
509 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 
514 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 
521 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 
487 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  49.8 
 
 
491 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
495 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
508 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  48.23 
 
 
516 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
492 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  44.47 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
512 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
497 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
500 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
496 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 
494 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
496 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
520 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
496 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
496 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
496 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  44.11 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 
511 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  42.8 
 
 
501 aa  343  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
502 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 
480 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
465 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
492 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
470 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  23.18 
 
 
475 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
3706 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
551 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
1183 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.71 
 
 
744 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
526 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
2693 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
681 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
909 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
382 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.74 
 
 
1239 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
674 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1654 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
932 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
603 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3230  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
636 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00732898  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
732 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
834 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
1227 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
215 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
839 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
585 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
1253 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
790 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
874 aa  100  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  29.37 
 
 
676 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
815 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
400 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
875 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.97 
 
 
895 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
535 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
991 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
462 aa  96.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
631 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  28.39 
 
 
918 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1714 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
764 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  32 
 
 
524 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
1676 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
1093 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.15 
 
 
936 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
398 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
1246 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
941 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
414 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
945 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
756 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.24 
 
 
348 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  26.91 
 
 
754 aa  93.6  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
356 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
511 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>