204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0722 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 337 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  61.95 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  60.12 
 
 		 316 aa  359  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  59.82 
 
 		 318 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  59.82 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  53.92 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  58.21 
 
 		 321 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  53.93 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  34.74 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  34.64 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  35.67 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  34.52 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  36.67 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  36.67 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.88 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.57 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.72 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.7 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.5 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.54 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.08 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.57 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.83 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.51 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.75 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  31.81 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.08 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  31.96 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.81 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.25 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.36 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.93 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.61 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.53 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.55 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.87 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  21.75 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  30.22 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.67 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.97 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.88 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.82 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.88 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  28.07 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>