More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01003 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  79.59 
 
 		 502 aa  816    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  997    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  54.61 
 
 		 472 aa  544  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  48.86 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  47.18 
 
 		 433 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  42.26 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  39.28 
 
 		 485 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 516 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 		 505 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  37.13 
 
 		 500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  36.24 
 
 		 508 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  36.21 
 
 		 481 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  36.56 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 505 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  34.35 
 
 		 517 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  31.24 
 
 		 473 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  29.79 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  28.31 
 
 		 473 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  30.02 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  28.38 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  27.31 
 
 		 475 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  27.27 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  27.46 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  28.3 
 
 		 468 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  27 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  27 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  27.35 
 
 		 714 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  27.85 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  27.43 
 
 		 457 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  25.66 
 
 		 486 aa  123  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  26.26 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  26.13 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  25.52 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  25.46 
 
 		 449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  25.44 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  25.31 
 
 		 498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  23.26 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  24.44 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  27.59 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  26.41 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  27.16 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  26.85 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  24.72 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  25.27 
 
 		 467 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  24.52 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  26.25 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  26.65 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  26.17 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  25.11 
 
 		 511 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  24.68 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  28.06 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  24.32 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  25.1 
 
 		 534 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  23.37 
 
 		 501 aa  97.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  25.57 
 
 		 502 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  22.47 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  24.25 
 
 		 494 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  26.8 
 
 		 476 aa  93.6  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  23.65 
 
 		 523 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  26.52 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  23.88 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2792  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase-related protein  25.81 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  23.92 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  23.47 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  24.82 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  25.19 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  25.19 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  24.68 
 
 		 476 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  26.05 
 
 		 523 aa  87.8  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  24.94 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  25.43 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  25.19 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  24.08 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  24.55 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  24.16 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  24.06 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  25.54 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2288  Lytic transglycosylase catalytic  24.44 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0288  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.73 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  27.16 
 
 		 508 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  21.88 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1222  putative transglycosylase  27.16 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.68 
 
 		 651 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  36.17 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  24.89 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  33.87 
 
 		 281 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  39.09 
 
 		 292 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 235 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0175  transglycosylase SLT domain-containing protein  26.25 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>