More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2567 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  100 
 
 
325 aa  627  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  58.36 
 
 
306 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  44.95 
 
 
390 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  41.84 
 
 
291 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
449 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
297 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  40.85 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
297 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  36.06 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
317 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  31.79 
 
 
295 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  36.6 
 
 
291 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.42 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.63 
 
 
287 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.24 
 
 
288 aa  103  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  33.02 
 
 
321 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
314 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.98 
 
 
320 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.99 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  33.44 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30.89 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32 
 
 
307 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  27 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  39.86 
 
 
151 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
274 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.27 
 
 
290 aa  86.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.64 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  31.67 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.49 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  40.14 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.13 
 
 
415 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
145 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.17 
 
 
287 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.86 
 
 
144 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  39.58 
 
 
155 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.65 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.84 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  33.63 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.77 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.64 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.97 
 
 
145 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.01 
 
 
151 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
144 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.97 
 
 
145 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
145 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
145 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.1 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.52 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.23 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.13 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  38.46 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.97 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.83 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.39 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.3 
 
 
150 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  29.34 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.43 
 
 
150 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.81 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  34.69 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.84 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  34.69 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.97 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  37.24 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.13 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.93 
 
 
142 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.88 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.39 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.1 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  33.56 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.25 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.42 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  39.04 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.73 
 
 
147 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.26 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.47 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.9 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
156 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.49 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  28.85 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.56 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.39 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>