More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2461 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 929 aa  1904    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3871  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.52 
 
 		 924 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3865  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.89 
 
 		 918 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.160045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3896  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.85 
 
 		 951 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0623338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.02 
 
 		 1056 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.92 
 
 		 1088 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3081  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 1149 aa  332  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.26 
 
 		 892 aa  201  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  25.69 
 
 		 889 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.63 
 
 		 923 aa  164  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.96 
 
 		 738 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 686 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 916 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0991  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 		 914 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.957169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 		 905 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  25.64 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  26.63 
 
 		 945 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  26.94 
 
 		 590 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.75 
 
 		 558 aa  124  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.1 
 
 		 901 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.41 
 
 		 614 aa  122  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  24.89 
 
 		 603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  24.89 
 
 		 603 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  24.89 
 
 		 603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  24.68 
 
 		 603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  24.68 
 
 		 603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  24.89 
 
 		 603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  24.89 
 
 		 603 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.23 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.57 
 
 		 750 aa  115  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.95 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  24.47 
 
 		 603 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.13 
 
 		 609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.36 
 
 		 743 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.33 
 
 		 757 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.73 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25 
 
 		 644 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  27.37 
 
 		 597 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.66 
 
 		 575 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 734 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.28 
 
 		 623 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.04 
 
 		 1045 aa  108  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 803 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.62 
 
 		 591 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.75 
 
 		 932 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.56 
 
 		 1076 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.51 
 
 		 805 aa  105  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.25 
 
 		 884 aa  105  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.63 
 
 		 1264 aa  104  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  23.87 
 
 		 600 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.13 
 
 		 621 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.97 
 
 		 980 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.89 
 
 		 815 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.35 
 
 		 619 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  25.38 
 
 		 1036 aa  103  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.46 
 
 		 614 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.3 
 
 		 604 aa  102  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 603 aa  102  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.63 
 
 		 620 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.04 
 
 		 800 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.55 
 
 		 1033 aa  101  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 888 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  24.89 
 
 		 598 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  25.12 
 
 		 1084 aa  99.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  24.83 
 
 		 677 aa  99  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.4 
 
 		 640 aa  98.6  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  26.6 
 
 		 587 aa  98.2  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 		 1084 aa  97.8  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.09 
 
 		 972 aa  97.8  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.32 
 
 		 1064 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  23.5 
 
 		 577 aa  96.3  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.17 
 
 		 1035 aa  96.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  21.68 
 
 		 1046 aa  97.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.18 
 
 		 1059 aa  96.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.69 
 
 		 744 aa  96.3  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.54 
 
 		 651 aa  95.9  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  25.26 
 
 		 785 aa  95.5  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.68 
 
 		 598 aa  95.1  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.22 
 
 		 568 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  24.65 
 
 		 600 aa  95.1  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.21 
 
 		 1013 aa  95.1  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  25.12 
 
 		 563 aa  94.7  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  23.96 
 
 		 596 aa  94.4  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.68 
 
 		 858 aa  94.4  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.84 
 
 		 799 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.43 
 
 		 619 aa  94  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 920 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  26.8 
 
 		 512 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.54 
 
 		 1030 aa  93.2  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.98 
 
 		 1108 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 1045 aa  92.8  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 627 aa  92.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  25.06 
 
 		 564 aa  92  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  26.63 
 
 		 707 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.84 
 
 		 811 aa  92  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.39 
 
 		 603 aa  92  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  24.71 
 
 		 625 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.27 
 
 		 837 aa  91.3  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 1049 aa  91.3  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  24.14 
 
 		 1023 aa  90.9  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>