More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1744 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  43.94 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  40.6 
 
 
300 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  44.67 
 
 
297 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.26 
 
 
297 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  41.92 
 
 
317 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.46 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  45.64 
 
 
151 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.45 
 
 
299 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.8 
 
 
297 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  43.15 
 
 
152 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.56 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.59 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.85 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.4 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.74 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.01 
 
 
305 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.57 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.26 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.34 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  30.56 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.39 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.21 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.6 
 
 
150 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  35.66 
 
 
143 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 
289 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.26 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  38.46 
 
 
147 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.21 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  39.72 
 
 
138 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36.62 
 
 
143 aa  86.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.56 
 
 
164 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.9 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.21 
 
 
282 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  32.76 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.02 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.41 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  30.06 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.6 
 
 
297 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.33 
 
 
149 aa  85.9  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  35.51 
 
 
165 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.38 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.87 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.64 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.14 
 
 
142 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.62 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.48 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  30.29 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
147 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.67 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.08 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  31.17 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.85 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.62 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  40.85 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  34.2 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.73 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.8 
 
 
139 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.82 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  23.89 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.43 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.46 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  33.94 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.97 
 
 
150 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  36.94 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  27.87 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.17 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.62 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.17 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.19 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.21 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.39 
 
 
141 aa  79  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  31.9 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 
293 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.89 
 
 
156 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.36 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  31.62 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  37.09 
 
 
168 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.99 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.18 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.21 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.34 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.01 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>