More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3255 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  100 
 
 		 769 aa  1514    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  48.2 
 
 		 821 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  52.09 
 
 		 817 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  49.25 
 
 		 801 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  43.77 
 
 		 669 aa  480  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  42.61 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  43.7 
 
 		 841 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  39.09 
 
 		 807 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  39.37 
 
 		 843 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  38.76 
 
 		 735 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  40.6 
 
 		 637 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  39.89 
 
 		 854 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  39.12 
 
 		 697 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  39.38 
 
 		 683 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 		 1132 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.06 
 
 		 836 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  39.58 
 
 		 991 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 1007 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  36.39 
 
 		 797 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  34.54 
 
 		 854 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  34.21 
 
 		 839 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  35.32 
 
 		 795 aa  366  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  37.09 
 
 		 818 aa  356  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  37.02 
 
 		 829 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.99 
 
 		 805 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  36.01 
 
 		 763 aa  343  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  35.51 
 
 		 769 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  38.89 
 
 		 950 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.96 
 
 		 687 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  36.9 
 
 		 1560 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  36.06 
 
 		 965 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  37.12 
 
 		 973 aa  296  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  37.06 
 
 		 1026 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  34.24 
 
 		 1281 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 1282 aa  272  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.63 
 
 		 1049 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.85 
 
 		 817 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  33.76 
 
 		 1051 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  32.15 
 
 		 1004 aa  261  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.37 
 
 		 957 aa  260  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  33.57 
 
 		 974 aa  260  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  33.33 
 
 		 1023 aa  260  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 1119 aa  257  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 1268 aa  251  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.7 
 
 		 1031 aa  251  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  33.97 
 
 		 1148 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 1182 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  34.2 
 
 		 950 aa  247  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 1077 aa  242  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.94 
 
 		 879 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  31.32 
 
 		 996 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  39.38 
 
 		 1092 aa  241  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  33.48 
 
 		 1022 aa  240  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  32.38 
 
 		 1164 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  31.35 
 
 		 1060 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.91 
 
 		 670 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 860 aa  217  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  40.82 
 
 		 1152 aa  212  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  34.18 
 
 		 1047 aa  212  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  36.9 
 
 		 1402 aa  209  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  37.1 
 
 		 1310 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 1435 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  28.99 
 
 		 832 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 851 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 851 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 851 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  33.26 
 
 		 895 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1034 aa  202  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  39.83 
 
 		 876 aa  198  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  30.46 
 
 		 814 aa  197  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  29.44 
 
 		 794 aa  194  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 803 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  30 
 
 		 1000 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  42.86 
 
 		 1076 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  41.83 
 
 		 733 aa  191  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  34.85 
 
 		 863 aa  187  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  34.86 
 
 		 799 aa  184  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  38.28 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  32.56 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  35.9 
 
 		 798 aa  164  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  33.75 
 
 		 839 aa  161  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  37.89 
 
 		 436 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  34.11 
 
 		 484 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  43.28 
 
 		 769 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  41.38 
 
 		 575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  36.48 
 
 		 600 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 453 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.38 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  37.61 
 
 		 832 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 412 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  38.94 
 
 		 630 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  31.21 
 
 		 524 aa  119  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  32.43 
 
 		 458 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  35.71 
 
 		 485 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  35.96 
 
 		 539 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  34.07 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.51 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 456 aa  60.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>