102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0548 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  24.02 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  40.91 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  23.45 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  25.35 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 222 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 191 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 224 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 210 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 207 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 218 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 188 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 190 aa  41.6  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>