More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0110 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  279  7.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  97.89 
 
 		 142 aa  272  9e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  36.14 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  43.75 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  29.06 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  29.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.1 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  30.12 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  33 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  25.84 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  25.84 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>