137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  100 
 
 		 996 aa  1996    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  43.8 
 
 		 1060 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  34.45 
 
 		 879 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  33.69 
 
 		 950 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.16 
 
 		 973 aa  389  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.03 
 
 		 1049 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  37.01 
 
 		 1560 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 1182 aa  355  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  37.36 
 
 		 1281 aa  352  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  31.4 
 
 		 974 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  37.31 
 
 		 1004 aa  341  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 1119 aa  334  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1282 aa  331  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 1268 aa  328  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  37.65 
 
 		 1023 aa  326  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  37.08 
 
 		 950 aa  320  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  34.34 
 
 		 1051 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  37.43 
 
 		 1164 aa  303  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1132 aa  298  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  33.62 
 
 		 1031 aa  293  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 1007 aa  281  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  34.52 
 
 		 1022 aa  275  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.47 
 
 		 860 aa  265  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  31.89 
 
 		 905 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 851 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 851 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.83 
 
 		 851 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  32.47 
 
 		 817 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  36.59 
 
 		 1047 aa  261  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 803 aa  252  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  45.37 
 
 		 817 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  40.18 
 
 		 836 aa  248  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.74 
 
 		 1026 aa  244  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  30.91 
 
 		 807 aa  244  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  32.14 
 
 		 797 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  30.33 
 
 		 1000 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  37.12 
 
 		 669 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  40.15 
 
 		 876 aa  238  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  43.91 
 
 		 769 aa  238  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  28.71 
 
 		 821 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  43.04 
 
 		 841 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  27.95 
 
 		 832 aa  233  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  40.64 
 
 		 854 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  37.91 
 
 		 991 aa  233  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  39.03 
 
 		 794 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  31.92 
 
 		 683 aa  228  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  39.5 
 
 		 637 aa  227  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1435 aa  227  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  38.85 
 
 		 818 aa  226  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  40.81 
 
 		 1402 aa  226  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  39.11 
 
 		 801 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  30.28 
 
 		 697 aa  225  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  38.98 
 
 		 1152 aa  222  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  32.14 
 
 		 839 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  37.5 
 
 		 814 aa  218  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  43.89 
 
 		 843 aa  217  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  41.72 
 
 		 735 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  43.14 
 
 		 763 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  33.39 
 
 		 839 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  41.75 
 
 		 854 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  39.4 
 
 		 1310 aa  212  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  41.72 
 
 		 863 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  31.01 
 
 		 795 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  39.37 
 
 		 965 aa  210  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  38.57 
 
 		 895 aa  210  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  39.45 
 
 		 687 aa  208  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  37.57 
 
 		 764 aa  207  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  38.4 
 
 		 829 aa  207  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 1034 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  32.63 
 
 		 798 aa  205  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  31.31 
 
 		 769 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.39 
 
 		 733 aa  198  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  37.29 
 
 		 799 aa  189  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  35.51 
 
 		 805 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  45.74 
 
 		 670 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  46.36 
 
 		 832 aa  183  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  33.09 
 
 		 1076 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  40.68 
 
 		 575 aa  154  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  43.24 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  36.23 
 
 		 516 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  37.55 
 
 		 436 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  38.89 
 
 		 484 aa  126  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 412 aa  111  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  34.87 
 
 		 465 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  29.61 
 
 		 600 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  32.51 
 
 		 630 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  33.2 
 
 		 524 aa  102  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  32.37 
 
 		 485 aa  92  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 453 aa  92  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  32.34 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  46.59 
 
 		 1092 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  31.52 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 1077 aa  68.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  37.93 
 
 		 1148 aa  58.9  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0413  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.82 
 
 		 653 aa  55.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0739  hypothetical protein  39.08 
 
 		 499 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  23.91 
 
 		 436 aa  54.3  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.13 
 
 		 957 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 		 464 aa  51.2  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  31.3 
 
 		 461 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>