More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4463 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  71.53 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  39.84 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  33.08 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0262  regulatory protein MarR  32.03 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.867817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  37.96 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.3 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.08 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  22.12 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  35.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  35.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  35.83 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.17 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 139 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  44.64 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.72 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2756  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 340 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 326 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  36.84 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>