116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1826 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
168 aa  350  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  87.5 
 
 
159 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  90.48 
 
 
154 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  90.48 
 
 
154 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  90.48 
 
 
154 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
165 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
165 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
165 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  81.6 
 
 
335 aa  279  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  90.21 
 
 
165 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  90.28 
 
 
332 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  85.81 
 
 
334 aa  273  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  88.11 
 
 
154 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  84.62 
 
 
329 aa  265  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  81.51 
 
 
147 aa  263  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  79.73 
 
 
155 aa  262  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 
144 aa  189  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  55.63 
 
 
148 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  56.74 
 
 
148 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.48 
 
 
148 aa  184  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  54.93 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
160 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
160 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
160 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
139 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
150 aa  134  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
145 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.73 
 
 
172 aa  120  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  38.3 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  37.14 
 
 
163 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  36.76 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  41.46 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  39.53 
 
 
301 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
304 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.62 
 
 
295 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 
319 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
128 aa  88.6  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.87 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.48 
 
 
167 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  28.35 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
233 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  23.62 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  26.67 
 
 
157 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  26.47 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.93 
 
 
138 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  24.43 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.7 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  23.66 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  24.68 
 
 
161 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  24.8 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  24.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  24.68 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  24.32 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  24.68 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  25.19 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  26.28 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  23.62 
 
 
136 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  23.62 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  16.79 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.19 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  22.63 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  28.72 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  23.85 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  26.36 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  26.36 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  26.36 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.36 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  24.63 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  32.14 
 
 
154 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  30.91 
 
 
163 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  25.2 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  27.13 
 
 
154 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  25.36 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  25.36 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>