206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3385 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 573 aa  1160    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  97.38 
 
 		 573 aa  1069    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  97.21 
 
 		 573 aa  1071    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  53.32 
 
 		 576 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  31.09 
 
 		 544 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  32.34 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.69 
 
 		 531 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.9 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 533 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.02 
 
 		 517 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.85 
 
 		 658 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 		 679 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  27.57 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.21 
 
 		 607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 664 aa  157  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 701 aa  157  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.64 
 
 		 572 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 572 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.94 
 
 		 667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  25.05 
 
 		 619 aa  147  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 612 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 644 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.08 
 
 		 572 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 657 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  29.44 
 
 		 577 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.9 
 
 		 690 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 690 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  27.83 
 
 		 646 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  35.74 
 
 		 304 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.51 
 
 		 692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 612 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 572 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 693 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.19 
 
 		 599 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 681 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 687 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 680 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  29.91 
 
 		 701 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 588 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 650 aa  126  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  28.66 
 
 		 310 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.49 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.26 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.48 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  25.82 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 693 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  26.68 
 
 		 585 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 691 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 		 339 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.57 
 
 		 339 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 		 345 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  26.17 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.71 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  26.79 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  32.21 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.18 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 329 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  23.46 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  26.52 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.72 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 754 aa  64.3  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.33 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.15 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  23.18 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  26.9 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  23.98 
 
 		 359 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  23.34 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.06 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  26.61 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  26.09 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>