More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1616 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1112    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 810 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 878 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.82 
 
 		 626 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 632 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.43 
 
 		 795 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 635 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 635 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 		 626 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 562 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1276 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 614 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.32 
 
 		 865 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 611 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.05 
 
 		 887 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 681 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 620 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.65 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.3 
 
 		 816 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 612 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.07 
 
 		 1694 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 636 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 637 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 1737 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 750 aa  92.8  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 927 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 639 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 689 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 909 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 2240 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 784 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 615 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 955 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.16 
 
 		 622 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 3145 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 828 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 4079 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 3172 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 828 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 		 576 aa  87  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.32 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.44 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.79 
 
 		 1067 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.17 
 
 		 764 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 3301 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.14 
 
 		 1979 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 750 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.75 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 3035 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 594 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 602 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1676 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.42 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 573 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.08 
 
 		 573 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.89 
 
 		 676 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.68 
 
 		 733 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 4489 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  24.89 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.93 
 
 		 730 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1094 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 847 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.67 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 654 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.33 
 
 		 784 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 750 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.18 
 
 		 745 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 592 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 		 1486 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.7 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>