More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1653 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  59.45 
 
 		 545 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.17 
 
 		 545 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1653  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 538 aa  1079    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.17 
 
 		 545 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.08 
 
 		 545 aa  633  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 		 545 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  59.45 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.9 
 
 		 545 aa  626  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.06 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.25 
 
 		 545 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216283 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.7 
 
 		 545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1997  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.05 
 
 		 546 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.179465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 554 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 		 548 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 549 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 		 545 aa  279  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 548 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  34.43 
 
 		 556 aa  260  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 548 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 560 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.94 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 		 564 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 554 aa  231  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 554 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 		 555 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 554 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.95 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.82 
 
 		 553 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 544 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 554 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 554 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 554 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.69 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.32 
 
 		 544 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 554 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 638 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 		 645 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 		 645 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.28 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  34.44 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  41.19 
 
 		 558 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 544 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 541 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.02 
 
 		 554 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 637 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  33.67 
 
 		 629 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 		 637 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 568 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 645 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 		 638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  34.44 
 
 		 632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  34.11 
 
 		 629 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 		 638 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 629 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 		 636 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  33.95 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.38 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  33.67 
 
 		 629 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 554 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  33.05 
 
 		 553 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 554 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  31.31 
 
 		 549 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  35.07 
 
 		 632 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.97 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.12 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 541 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 713 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 639 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 645 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 643 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 		 495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  29.65 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.07 
 
 		 630 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  40.9 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 		 634 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.47 
 
 		 712 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  40.3 
 
 		 712 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>