More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4487 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  100 
 
 		 358 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  73.88 
 
 		 358 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  72.75 
 
 		 358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  75.5 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  55.3 
 
 		 352 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  51.68 
 
 		 358 aa  322  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  54.22 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  51.39 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  54.22 
 
 		 349 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  52.92 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  51.94 
 
 		 413 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  51.15 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  49.67 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  49.26 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  45.82 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  49.85 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  49.54 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  48.31 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.84 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 353 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  46.2 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  49.18 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  41.57 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  42.73 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  46.89 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  43.48 
 
 		 392 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  49.23 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  44.22 
 
 		 383 aa  242  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  46.18 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  43.15 
 
 		 375 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  43.08 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  45.16 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  44.91 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  40.19 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.63 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.02 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.48 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.9 
 
 		 366 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40.86 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.39 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.32 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.02 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.1 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  38.22 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.27 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  37.46 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  36.87 
 
 		 387 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  39.75 
 
 		 404 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.82 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.14 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  36.14 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  38.89 
 
 		 377 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.02 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.39 
 
 		 390 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  34.17 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 347 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.37 
 
 		 372 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.51 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  38.44 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  35.88 
 
 		 354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.23 
 
 		 401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  39.75 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  42.07 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.48 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 364 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.68 
 
 		 393 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.54 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  39.02 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  37.89 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  39.74 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  37.94 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  38.19 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.69 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  35.81 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  40.44 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  40.44 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  40.44 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  38.64 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  34.44 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>