More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4129 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1138    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  81.23 
 
 		 567 aa  936    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.61 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  40.91 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  31.44 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.91 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.6 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  31.98 
 
 		 437 aa  127  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  39.01 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  34.05 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.64 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  38.46 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  38.46 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 432 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  43.24 
 
 		 316 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  36.16 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  34.85 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.66 
 
 		 429 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.74 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  29 
 
 		 442 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 441 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.99 
 
 		 442 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.74 
 
 		 435 aa  120  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  30.33 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  32.3 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.15 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  30.33 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.69 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  33.7 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  29 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  29.84 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.76 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  34.21 
 
 		 421 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  29 
 
 		 442 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  29 
 
 		 442 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.1 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  29.07 
 
 		 442 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 440 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  34.39 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  27.88 
 
 		 442 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.16 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.62 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  35.81 
 
 		 432 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  35.22 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  35.38 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  35.38 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  35.1 
 
 		 642 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  32.27 
 
 		 432 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.9 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  36.48 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 		 969 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  32.27 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  34 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.85 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  35.43 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 451 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.91 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  35.71 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 450 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.7 
 
 		 457 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  34.2 
 
 		 450 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.98 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.15 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.07 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.74 
 
 		 438 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.05 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  33.04 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  35.87 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.1 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.85 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31 
 
 		 428 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.47 
 
 		 436 aa  107  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.56 
 
 		 442 aa  107  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  32.89 
 
 		 430 aa  107  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.62 
 
 		 298 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.9 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  28.69 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  29.31 
 
 		 414 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>