More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3222 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  100 
 
 		 547 aa  1119    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  72.05 
 
 		 908 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  55 
 
 		 956 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  55 
 
 		 956 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  53.68 
 
 		 955 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  48.65 
 
 		 902 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  45.55 
 
 		 928 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0127  putative Rhs element Vgr protein  45.55 
 
 		 928 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1582  Rhs element Vgr protein  45.29 
 
 		 858 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.371781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0207  Rhs element Vgr protein  45.29 
 
 		 921 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0113608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0100  Rhs element Vgr protein  45.29 
 
 		 926 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  43.95 
 
 		 926 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  43.95 
 
 		 926 aa  300  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  41.76 
 
 		 922 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  41.22 
 
 		 922 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4520  type VI secretion system Vgr family protein  40.11 
 
 		 927 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 		 906 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  26.9 
 
 		 906 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.88 
 
 		 1063 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.88 
 
 		 1063 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.88 
 
 		 1063 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 875 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 1057 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.42 
 
 		 1059 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 871 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 618 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 		 920 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 933 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  26.49 
 
 		 1057 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  24.46 
 
 		 869 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.12 
 
 		 852 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  27.84 
 
 		 918 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 890 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 920 aa  98.2  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  25.95 
 
 		 1074 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 855 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  26.68 
 
 		 892 aa  94  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  24.73 
 
 		 614 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 853 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  25.82 
 
 		 730 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 853 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  22.72 
 
 		 618 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  22.57 
 
 		 958 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 853 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  24.2 
 
 		 847 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  26.3 
 
 		 843 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 923 aa  87  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 946 aa  87  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  24.2 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.52 
 
 		 946 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.86 
 
 		 898 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  29.67 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 946 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.84 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.33 
 
 		 942 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  22.95 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  26.98 
 
 		 843 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  25.2 
 
 		 741 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  23.18 
 
 		 850 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  23.84 
 
 		 895 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  24.86 
 
 		 891 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  28.45 
 
 		 767 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 895 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 910 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 		 907 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.29 
 
 		 895 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  25.4 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  26.98 
 
 		 849 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  25.2 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  25.08 
 
 		 774 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  21.93 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  21.93 
 
 		 850 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 		 847 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  26.55 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  22.37 
 
 		 661 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  22.58 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  24.76 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 		 841 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  22.11 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  22.11 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 947 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  22.4 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  22.11 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 		 841 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  22.11 
 
 		 661 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  23.49 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  22.37 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  22.01 
 
 		 661 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  24.44 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  25.8 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  24.76 
 
 		 748 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  26.64 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  22.34 
 
 		 834 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  22.34 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  22.34 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  29.28 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  23.46 
 
 		 841 aa  73.6  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 1094 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>