102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4200 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  801    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 402 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  33.06 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  34.32 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  33.08 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 403 aa  152  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.78 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 427 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  26.2 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  27.69 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.78 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 442 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  26.49 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  23.19 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  26.4 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  26.45 
 
 		 184 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  25.33 
 
 		 500 aa  46.6  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.68 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.83 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  24.09 
 
 		 917 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  27.01 
 
 		 893 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  40 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.01 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  23.36 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 473 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  22.54 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  26.69 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>