239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02223 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  100 
 
 		 324 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  84.67 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  84.67 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  69.6 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  70.91 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  55.76 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  48.09 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  44.01 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  45.6 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  53.1 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  47.52 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  48.71 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  47.33 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  43.25 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  41.04 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  49.12 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  44.21 
 
 		 347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  39.45 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  41.34 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  39.64 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  37.85 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  40.77 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  39.58 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  38.85 
 
 		 424 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  38.41 
 
 		 443 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  38.99 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  39.72 
 
 		 324 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  39.3 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  41.7 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  37.59 
 
 		 337 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  37.59 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  37.59 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  37.59 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  37.59 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  37.59 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  35.92 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  38.49 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  40 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  36.43 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  38.95 
 
 		 436 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  36.43 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  37.24 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  35.17 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  35.29 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  35.29 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  36.05 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  36.05 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  35.66 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  38.73 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  39.07 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  34.6 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  40.52 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  38.11 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  41.54 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  40.67 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  37.33 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  32.99 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  33.6 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  32.37 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  32.82 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  32.57 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  32.57 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  34.63 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  25.34 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  25 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.57 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.57 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  24.21 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  28.36 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3545  ribonuclease BN  26.71 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.109526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  28.63 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  25.69 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  38.37 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  38.37 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.29 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  26.28 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  25.18 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1463  serum resistance locus BrkB-like protein  27.55 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01651  serum resistance locus BrkB-like protein  27.55 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.596268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  28.42 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.83 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>