88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3572 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3572    100 
 
 		 294 bp  583  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.15 
 
 		 1692 bp  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.86 
 
 		 1695 bp  165  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.36 
 
 		 1692 bp  159  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.39 
 
 		 1764 bp  153  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.39 
 
 		 2022 bp  153  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.18 
 
 		 1692 bp  143  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  83.74 
 
 		 1692 bp  141  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.43 
 
 		 1704 bp  141  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.57 
 
 		 2070 bp  141  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  83.74 
 
 		 2028 bp  141  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4173    83.66 
 
 		 1692 bp  139  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.74 
 
 		 1692 bp  135  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.53 
 
 		 1692 bp  133  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.51 
 
 		 1689 bp  131  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.19 
 
 		 1701 bp  131  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  89.81 
 
 		 2067 bp  127  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  82.76 
 
 		 1692 bp  125  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.76 
 
 		 2019 bp  125  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.57 
 
 		 1692 bp  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.57 
 
 		 1701 bp  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  83.73 
 
 		 2025 bp  115  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.68 
 
 		 1686 bp  115  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.61 
 
 		 2067 bp  113  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  83.85 
 
 		 1809 bp  113  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.29 
 
 		 1719 bp  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82 
 
 		 1704 bp  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  82.94 
 
 		 1971 bp  107  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.12 
 
 		 1692 bp  105  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.46 
 
 		 2028 bp  105  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.93 
 
 		 1704 bp  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.66 
 
 		 1683 bp  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.92 
 
 		 1692 bp  101  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.16 
 
 		 2067 bp  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.28 
 
 		 1707 bp  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.96 
 
 		 1692 bp  99.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.85 
 
 		 1686 bp  91.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.09 
 
 		 2226 bp  91.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  80.58 
 
 		 2067 bp  91.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  82.98 
 
 		 2076 bp  89.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.99 
 
 		 2013 bp  89.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.36 
 
 		 1686 bp  85.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.32 
 
 		 1692 bp  85.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.67 
 
 		 1968 bp  83.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  90 
 
 		 1707 bp  83.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.84 
 
 		 2196 bp  83.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.52 
 
 		 1692 bp  81.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.5 
 
 		 1971 bp  79.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  86.75 
 
 		 1698 bp  77.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  82.79 
 
 		 1701 bp  75.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  82.31 
 
 		 2076 bp  75.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.09 
 
 		 1722 bp  75.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.75 
 
 		 1707 bp  73.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1919  chemotaxis sensory transducer  88.24 
 
 		 636 bp  71.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.45 
 
 		 1692 bp  71.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.851708  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  85.23 
 
 		 1695 bp  71.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.65 
 
 		 2025 bp  71.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  91.07 
 
 		 2124 bp  71.9  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  86.25 
 
 		 1971 bp  71.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 1692 bp  69.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  80.65 
 
 		 1692 bp  69.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.08 
 
 		 1287 bp  69.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  85.37 
 
 		 1698 bp  67.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  84.71 
 
 		 1671 bp  65.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  84.71 
 
 		 1707 bp  65.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  86.96 
 
 		 2151 bp  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  82.69 
 
 		 1689 bp  63.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  82.69 
 
 		 1686 bp  63.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.52 
 
 		 1692 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  88.14 
 
 		 2139 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1686 bp  61.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.47 
 
 		 2097 bp  58  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  96.88 
 
 		 2097 bp  56  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.88 
 
 		 1686 bp  56  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  83.75 
 
 		 1629 bp  56  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  79.27 
 
 		 1686 bp  56  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.93 
 
 		 1692 bp  52  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4059  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.85 
 
 		 1692 bp  52  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  85.48 
 
 		 1710 bp  52  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.94 
 
 		 1686 bp  50.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.24 
 
 		 1971 bp  50.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  96.55 
 
 		 1686 bp  50.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.64 
 
 		 2517 bp  48.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 2145 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.77 
 
 		 2076 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.52 
 
 		 1962 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  81.61 
 
 		 1734 bp  46.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  96.3 
 
 		 984 bp  46.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>