128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2907 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  100 
 
 		 226 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  38.25 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3199  secretin/TonB, short-like  34.65 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0762853  hitchhiker  0.00345438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55560  hypothetical protein  35.2 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0430636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4836  hypothetical protein  35.42 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2211  hypothetical protein  33.5 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  33.49 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0479  secretin/TonB, short-like protein  33.64 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.084644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2100  hypothetical protein  32.35 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.223696  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2204  hypothetical protein  31.73 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268993  normal  0.0685137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80044  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 1020 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3314  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 973 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  37.78 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  40 
 
 		 833 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 822 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2231  secretin/TonB, short-like protein  28.49 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 		 821 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  38.61 
 
 		 778 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  27.93 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  44.05 
 
 		 862 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  44.05 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  42.05 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  39.08 
 
 		 784 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  33.63 
 
 		 817 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  37.04 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 836 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  32.54 
 
 		 1186 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 809 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 844 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 879 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  30.4 
 
 		 812 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  31.78 
 
 		 633 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 808 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  39.13 
 
 		 809 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 		 847 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 		 812 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.84 
 
 		 817 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.03 
 
 		 807 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 		 829 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  40.32 
 
 		 808 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 808 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  36.71 
 
 		 792 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 864 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  30.09 
 
 		 794 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1411  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.71 
 
 		 892 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1040 aa  51.6  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  41.89 
 
 		 819 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1351  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 1188 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.32258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 791 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  36.25 
 
 		 804 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 778 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  38.46 
 
 		 812 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  36.56 
 
 		 862 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  41.38 
 
 		 797 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20010  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  28.26 
 
 		 891 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0486368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 		 817 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 		 777 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  42.11 
 
 		 826 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 829 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3722  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 896 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.275954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  34.09 
 
 		 518 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 839 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 959 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 840 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  36.62 
 
 		 821 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  34.72 
 
 		 782 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  26.36 
 
 		 813 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  36.99 
 
 		 815 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  33.33 
 
 		 782 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  32.29 
 
 		 803 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  30.37 
 
 		 791 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1720  heme uptake outer membrane receptor HasR precursor  27.37 
 
 		 885 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95463  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 851 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  27.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 982 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 787 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 841 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 835 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 804 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 		 799 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  42.11 
 
 		 864 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 743 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 858 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  32.14 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  35.71 
 
 		 804 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1814  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.77 
 
 		 892 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 897 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 797 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.68 
 
 		 833 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  34.65 
 
 		 861 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  27.43 
 
 		 816 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 795 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 		 810 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 796 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.38 
 
 		 825 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  33.82 
 
 		 807 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 796 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 799 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>