93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2906 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  100 
 
 		 235 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  34.74 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  42.22 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  34.13 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  42.5 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  42.5 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  33.96 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  44.16 
 
 		 286 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  41.11 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  41.25 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  36.61 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.27 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  36.61 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  41.18 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  35.71 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.93 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  36.78 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  36.36 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  38.67 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  31.5 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.24 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  37.5 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  35.63 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  37.5 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.53 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  40.28 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  34.78 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.78 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  33.33 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.78 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  28.98 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  41.33 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  36.28 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.57 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  33.75 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  37.04 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  36.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  32.94 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  37.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  31.88 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  26.23 
 
 		 431 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  38.46 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  40.79 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  26.71 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  37.97 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  37.97 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  44.44 
 
 		 164 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  44.44 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  26.03 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  34.44 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  39.06 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  28.65 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  39.13 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  35.06 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  32.89 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  40.98 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  34.52 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  37.68 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  40.35 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  30.69 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  37.68 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.23 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  29.89 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  37.68 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.17 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  24.29 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.17 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  33.33 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  28.05 
 
 		 317 aa  45.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.08 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  36.23 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  40 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  28.57 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  36.23 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  36.23 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  28.57 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  25 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  33.86 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.27 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  34.91 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  38.67 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  39.13 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  28.97 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  31.94 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  28.97 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  31.88 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  28.41 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  40 
 
 		 343 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  28.25 
 
 		 269 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.63 
 
 		 249 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0505  TonB family protein  33.66 
 
 		 169 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>