170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3337 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 361 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.71 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 		 616 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1676 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 1186 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  24.16 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.3 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.08 
 
 		 837 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 534 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 878 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 2240 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 673 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1967  TPR domain-containing protein  37.4 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.74 
 
 		 810 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 		 632 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  30.83 
 
 		 725 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 647 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 571 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 686 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 573 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  35.9 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1450 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.35 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 605 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 589 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 3145 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.98 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 883 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 542 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  44.44 
 
 		 708 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1421 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 423 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1451 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 585 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1454 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 766 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 1154 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 847 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.31 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.38 
 
 		 864 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 274 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  24.64 
 
 		 542 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0628  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 168 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0492452  hitchhiker  0.000000131478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 744 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 879 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1297 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 689 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 792 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.93 
 
 		 573 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 567 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  32.38 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 178 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 643 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 483 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 670 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.41 
 
 		 645 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.14 
 
 		 602 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 520 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 944 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 525 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 839 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.95 
 
 		 850 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 884 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  32.43 
 
 		 703 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.58 
 
 		 937 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 318 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.72 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 2262 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  31.96 
 
 		 577 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  28.4 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  24.52 
 
 		 734 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 		 730 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  21.33 
 
 		 604 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 917 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  31.96 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 685 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1138 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.45 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  36.9 
 
 		 725 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 537 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  31.82 
 
 		 841 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1406 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 808 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 		 632 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>