More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0190 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  71.18 
 
 		 479 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  100 
 
 		 471 aa  939    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  70.75 
 
 		 478 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  71.4 
 
 		 478 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  71.18 
 
 		 479 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  70.97 
 
 		 479 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  58.8 
 
 		 515 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  57.91 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  55.79 
 
 		 486 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  55.77 
 
 		 483 aa  498  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  55.25 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  54.39 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  55.39 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  54.75 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  48.1 
 
 		 495 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  41.1 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  40.75 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  38.07 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  33.19 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  28.1 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  26.14 
 
 		 486 aa  123  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  27.85 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.21 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  23.98 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  24.87 
 
 		 483 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  27.27 
 
 		 485 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.36 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  23.63 
 
 		 466 aa  96.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  23.74 
 
 		 479 aa  96.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.67 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  24.16 
 
 		 500 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 525 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  35.9 
 
 		 741 aa  91.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.33 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  23.22 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  23.22 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  23.59 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.16 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  25.36 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.35 
 
 		 506 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  25.21 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  23.27 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.84 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.53 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  25.31 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  26.2 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  23.83 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.76 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  24.78 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.74 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.07 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.68 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  22.15 
 
 		 590 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.1 
 
 		 520 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  27.27 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  28.21 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2325  Na+/solute symporter  22.49 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00258865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.53 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.01 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.3 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.06 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  26.78 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  25.05 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  25.35 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  21.48 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  22.71 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  22.87 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  26.5 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  23.31 
 
 		 958 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  23.17 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  25.26 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.5 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1248  Sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  22.47 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  25.56 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  23.78 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.89 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>