More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1103 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
407 aa  835    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  65.27 
 
 
407 aa  552  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  51.63 
 
 
396 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  51.63 
 
 
396 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.12 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  46.6 
 
 
421 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  43.42 
 
 
413 aa  349  4e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  43.07 
 
 
411 aa  339  5e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  42.34 
 
 
411 aa  336  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  39.66 
 
 
406 aa  332  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  36.54 
 
 
410 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  38.92 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  37.22 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  35.96 
 
 
409 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  40.38 
 
 
423 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  36.45 
 
 
413 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  36.45 
 
 
407 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  38.26 
 
 
415 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  39.52 
 
 
415 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  39.28 
 
 
415 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  38.78 
 
 
415 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
395 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.6 
 
 
398 aa  130  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 
399 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.24 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0788  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.69 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.770498  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 
410 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.26 
 
 
433 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.06 
 
 
375 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  23.9 
 
 
419 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.14 
 
 
404 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.41 
 
 
391 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  27.19 
 
 
442 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.82 
 
 
385 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.51 
 
 
442 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  23.22 
 
 
409 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.41 
 
 
391 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.17 
 
 
434 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.71 
 
 
424 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  27.44 
 
 
411 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  24.13 
 
 
380 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  23.83 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.31 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.79 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.07 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.26 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.5 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.95 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.79 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.5 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  22.14 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.63 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.8 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.8 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  26.77 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.46 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.8 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.93 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.8 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.8 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  24.78 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  24.5 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.63 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.22 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  22.72 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.22 
 
 
377 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.72 
 
 
376 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 
423 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.08 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.6 
 
 
452 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.34 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1523  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.32 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  23.94 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.22 
 
 
410 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  26.21 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1994  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.68 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.25 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.51 
 
 
457 aa  92  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2470  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847211  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  26.55 
 
 
411 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1992  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000000073122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  23.59 
 
 
462 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2188  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.59 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2367  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0319493  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  29.62 
 
 
465 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.12 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1912  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.12 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.12 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  21.48 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  29.55 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2482  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>