255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3101 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  831    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8475  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.38 
 
 		 434 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.72 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  24.38 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.03 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.95 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  24.1 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.59 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  24.53 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  22.8 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  23.82 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.54 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.87 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  24.59 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  22.26 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.25 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 457 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 418 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  25.26 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.21 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  23.6 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>