196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3822 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  100 
 
 		 528 aa  1085    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  40.54 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  41.68 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  37.64 
 
 		 579 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  41.42 
 
 		 533 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  57.72 
 
 		 341 aa  279  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  51.08 
 
 		 334 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.43 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.87 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.3 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29.87 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.76 
 
 		 674 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.31 
 
 		 598 aa  186  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  31.03 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.81 
 
 		 551 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.6 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.04 
 
 		 547 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.07 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.8 
 
 		 558 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.43 
 
 		 558 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.23 
 
 		 558 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.23 
 
 		 558 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.31 
 
 		 537 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  28.1 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  27.88 
 
 		 557 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  27.88 
 
 		 557 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.23 
 
 		 551 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  28.11 
 
 		 557 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  28.13 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  28.66 
 
 		 569 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.29 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  26.51 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.27 
 
 		 560 aa  160  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.86 
 
 		 557 aa  160  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  28.14 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  28.52 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.3 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.35 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  27.36 
 
 		 558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.28 
 
 		 522 aa  156  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.83 
 
 		 603 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  28.01 
 
 		 559 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.08 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.2 
 
 		 549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.48 
 
 		 563 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  26.3 
 
 		 597 aa  153  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.17 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.86 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.54 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  28.44 
 
 		 550 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.76 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.68 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  26.97 
 
 		 542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  27.97 
 
 		 529 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.13 
 
 		 550 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.62 
 
 		 529 aa  146  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  26.09 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.16 
 
 		 549 aa  144  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  26.55 
 
 		 550 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  28.91 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.22 
 
 		 552 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.48 
 
 		 552 aa  136  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.72 
 
 		 528 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  27.47 
 
 		 541 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  26.87 
 
 		 541 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  26.12 
 
 		 534 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.64 
 
 		 529 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  27.22 
 
 		 541 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  25.78 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  25.82 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  26.32 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  25.82 
 
 		 540 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  27.55 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.18 
 
 		 944 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  25.82 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35.8 
 
 		 323 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.47 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  37.09 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  33.06 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  37.39 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  25.05 
 
 		 623 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  24.16 
 
 		 424 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.3 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.24 
 
 		 555 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.39 
 
 		 574 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.16 
 
 		 309 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  36.19 
 
 		 308 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  22.39 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  23.74 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  24.26 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.21 
 
 		 330 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.35 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  24.05 
 
 		 573 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.57 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.07 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  30.77 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.35 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.36 
 
 		 1103 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.57 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.57 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>