More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1602 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  59.35 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  43.27 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  42.38 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  47.06 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  40.85 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  37.69 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  35.94 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  35.85 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  34.31 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  32.06 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.5 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  31.22 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  31.75 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  29.82 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  31.6 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  41.32 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  35.12 
 
 		 226 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.69 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  30.22 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  31.43 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  32.99 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 337 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.29 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  32.41 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  35.54 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  37.34 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  34.18 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.01 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.01 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.52 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.01 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.01 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.52 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.01 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.52 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  34.73 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  31.13 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  38.96 
 
 		 264 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  36.78 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  30 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.01 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.58 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  37.93 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  30.28 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.59 
 
 		 249 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  30.39 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  29.05 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  29.82 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.93 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  31.19 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  30.77 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.77 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.77 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.96 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  34.76 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  38.51 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>