106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0883 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0883  integrase family protein  100 
 
 		 404 aa  841    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002228  putative integrase  27.63 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  33.2 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  29.41 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4097  integrase family protein  30.91 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2498  Phage integrase  26.52 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0926  Phage integrase  24.42 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1730  hypothetical protein  29.88 
 
 		 616 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1223  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1447  integrase family protein  23.38 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  34.78 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4174  integrase family protein  32.78 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5437  integrase family protein  29.36 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.636069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0804  prolidase (Xaa-Pro dipeptidase; PepQ)  26.09 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0646  integrase family protein  27.27 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0135958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3951  hypothetical protein  25.43 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  31.98 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  27.78 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2641  phage integrase family protein  22.36 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3590  integrase family protein  31.74 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1749  integrase family protein  30.43 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000110171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3997  integrase family protein  24.56 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2466  hypothetical protein  24.1 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150601  normal  0.0506751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0954  integrase family protein  28.51 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1333  hypothetical protein  25.09 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0100601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1799  integrase family protein  25.97 
 
 		 531 aa  66.2  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0370566  normal  0.65053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2100  putative integrase  25.37 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5416  integrase family protein  26.25 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3428  integrase family protein  28.93 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2468  integrase family protein  31.91 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.475545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2470  phage integrase  26.8 
 
 		 564 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0462  integrase family protein  26.56 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853167  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  26.95 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2460  phage integrase family protein  28 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0793889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0215  integrase family protein  24.55 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.4 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6757  lambda integrase-like/ DNA breaking-rejoining enzyme, catalytic core  25.19 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  24.81 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6399  integrase family protein  22.67 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.346311 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  29.38 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  25.25 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0154  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3316  Phage integrase  21.33 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2361  putative integrase/resolvase recombinase protein phage-related integrase  26.07 
 
 		 605 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0808  phage integrase family site specific recombinase  26.34 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  23.23 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0135  integrase family protein  23.89 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  23.15 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0967  putative phage-related integrase  26.15 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0888  integrase family protein  22.79 
 
 		 687 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  22.48 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 301 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  23.6 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.93 
 
 		 282 aa  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4065  integrase family protein  25.32 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.438471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0865  integrase family protein  24.24 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  27.85 
 
 		 476 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4718  integrase family protein  28.75 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  24.37 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  21.69 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1802  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1486  integrase domain-containing protein  26.94 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  24.37 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  24.37 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  25.78 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4527  phage integrase family site specific recombinase  25.6 
 
 		 649 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.259982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1953  putative integrase  25.38 
 
 		 662 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0157061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0725  phage integrase  23.97 
 
 		 619 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011564  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.95 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5789  site-specific recombinase, phage integrase family  25.6 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  26.77 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 283 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 283 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  23.33 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.9 
 
 		 275 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  24.29 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  24.92 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003902  integrase  26.2 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  21.79 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3046  Phage integrase  26.36 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1796  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.84 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6546  hypothetical protein  29.3 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  hitchhiker  0.00680658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  29.63 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.3 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  22.88 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.17 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0586  site-specific recombinase, phage integrase family  25.16 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1015  integrase/recombinase XerC, putative  25.16 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.14 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  27.1 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1569  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  24.2 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1321  hypothetical protein  27.84 
 
 		 588 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>