More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1004 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  52.09 
 
 		 627 aa  663    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 648 aa  1334    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  34.03 
 
 		 591 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 358 aa  196  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  26.12 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 407 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  33.96 
 
 		 395 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 374 aa  170  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  33.83 
 
 		 394 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  31.54 
 
 		 375 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 361 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 349 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  34.81 
 
 		 395 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 374 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  29.44 
 
 		 371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 390 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 393 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 352 aa  161  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  36.07 
 
 		 393 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 361 aa  160  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  36.91 
 
 		 392 aa  160  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  36.57 
 
 		 374 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  34.65 
 
 		 357 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 353 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 391 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  34.65 
 
 		 361 aa  158  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  37.04 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  29.17 
 
 		 360 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 368 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 362 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  31.75 
 
 		 362 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 376 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 373 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 380 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 373 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  29.19 
 
 		 359 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.19 
 
 		 365 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 358 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  32.57 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 378 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 363 aa  138  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  32.48 
 
 		 379 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 365 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 400 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 399 aa  130  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 398 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 399 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 402 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 399 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  30.8 
 
 		 727 aa  124  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 		 308 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.81 
 
 		 351 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  27.41 
 
 		 545 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 307 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  22.56 
 
 		 648 aa  97.4  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  22.18 
 
 		 650 aa  94  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 268 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 		 1117 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  29.58 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  27.84 
 
 		 1134 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  27.84 
 
 		 1134 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4048  MscS mechanosensitive ion channel  21.84 
 
 		 569 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138882  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  31.47 
 
 		 1102 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  31.47 
 
 		 1102 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4873  MscS Mechanosensitive ion channel  21.33 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 843 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  29.92 
 
 		 1120 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>