More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1400 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 399 aa  807    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.64 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  49.05 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.03 
 
 		 376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  48.11 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  47.37 
 
 		 395 aa  347  3e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.44 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.8 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.76 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.66 
 
 		 393 aa  312  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  50.15 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.57 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.66 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.56 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 		 378 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.61 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.59 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  39.01 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.27 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.26 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 378 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.87 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.03 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  32.5 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  35.94 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 386 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  30.49 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  31.77 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  29.24 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.93 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  34.13 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  30.08 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  31.57 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  31.16 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  31.99 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.23 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.07 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  30.5 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  29.21 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  30.65 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  31.02 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  31.3 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.81 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.03 
 
 		 446 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.85 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  30.53 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  30 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  31.62 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 383 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  30.64 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  28.03 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.02 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  30.36 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  33.91 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>