103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0591 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  57.25 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  58.97 
 
 
265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  57.76 
 
 
271 aa  294  9e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  56.78 
 
 
268 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  54.91 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  48.83 
 
 
250 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  39.18 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  64.84 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.59 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.93 
 
 
390 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.21 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.78 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.65 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  33.33 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.01 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  40.23 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  34.65 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  26.79 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  32.26 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  34.07 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  37.18 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  26.99 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  35.63 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  35.63 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  32.54 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  32.22 
 
 
233 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.09 
 
 
112 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.58 
 
 
447 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.22 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.22 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  31.4 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.11 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  34.48 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.56 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  31.03 
 
 
319 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  32.98 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.83 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  34.94 
 
 
117 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40.51 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  30.59 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.18 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  34.48 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  28.99 
 
 
203 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  30.56 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  26.81 
 
 
203 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32.18 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.03 
 
 
203 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  29.59 
 
 
137 aa  48.9  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  37.04 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.03 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  26.92 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  26.5 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  29.59 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  32.18 
 
 
352 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  31.65 
 
 
485 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  33.7 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  37.04 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  34.07 
 
 
206 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  29.07 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  37.36 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.18 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  25.71 
 
 
472 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  29.07 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  31.82 
 
 
121 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  31.11 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  25.51 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  28.74 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  26.44 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  25.83 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.84 
 
 
804 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  33.33 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  31.25 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  28.74 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  40.58 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  34.44 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  31.53 
 
 
441 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  33.33 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  29.87 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.47 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  20.7 
 
 
489 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  30.48 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  27.31 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  37.8 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  34.15 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  30.86 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  31.25 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  28.42 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  26.18 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  29.59 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  26.37 
 
 
150 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  30.95 
 
 
668 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.59 
 
 
582 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  33.75 
 
 
206 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  38.98 
 
 
371 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  28.24 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  27.91 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  32.53 
 
 
221 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>