More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2494 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  81.94 
 
 		 301 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 308 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 298 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4682  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  48.84 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1345  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3226  LysR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  48.17 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3941  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  48.5 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5566  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0372777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3328  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8514  transcriptional regulator, LysR family  47.67 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4052  putative LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3317  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2247  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.711859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2765  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3429  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000310427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4728  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1525  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0463  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0971  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4126  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6433  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5003  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0083  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2089  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3225  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3770  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 301 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6536  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1921  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1700  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0519  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.84589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4963  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.463042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2351  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0828194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7100  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1975  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718981  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1521  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  38.13 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3912  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5569  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0364819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 334 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 334 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6852  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4867  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  44.25 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  39.1 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 334 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.98 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5526  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.77187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0820  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>