More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1366 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 402 aa  834    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  56.68 
 
 		 685 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  54.21 
 
 		 637 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  47.25 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  55.68 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 681 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 612 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  51.98 
 
 		 865 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  48.17 
 
 		 750 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  50.53 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  50.27 
 
 		 603 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  50 
 
 		 816 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  47.12 
 
 		 583 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  45.19 
 
 		 739 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  45.19 
 
 		 909 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  54.19 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  48.13 
 
 		 430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  41.28 
 
 		 467 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  54.55 
 
 		 653 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  53.62 
 
 		 661 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  46.29 
 
 		 514 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  53.47 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  41.76 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  41.18 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  45.91 
 
 		 235 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  29.23 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  49.32 
 
 		 529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  43.48 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 		 502 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  35.26 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  32.62 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  35.26 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  35.29 
 
 		 232 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  35.85 
 
 		 227 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 878 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  32 
 
 		 780 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  36.96 
 
 		 594 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.66 
 
 		 810 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.14 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  31.88 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 864 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 3145 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.82 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 542 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.75 
 
 		 725 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.62 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  34.86 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 955 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  35.96 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 766 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.08 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.65 
 
 		 622 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 1737 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.85 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 715 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.17 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 718 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  34.38 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 808 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1276 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 217 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 649 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 649 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 576 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 573 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  35.17 
 
 		 587 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.79 
 
 		 764 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.4 
 
 		 708 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  39.05 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 1486 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  34.43 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.05 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 		 1154 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.22 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 935 aa  63.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 1276 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.65 
 
 		 887 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 1034 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  32.33 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>