56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1318 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  48.42 
 
 
232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  45.45 
 
 
281 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  44.08 
 
 
322 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  47.24 
 
 
434 aa  161  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  47.24 
 
 
434 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  41.48 
 
 
282 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  37.44 
 
 
218 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  39.02 
 
 
382 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
402 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  30.61 
 
 
303 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  28.65 
 
 
316 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  30.82 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  33.82 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  28.19 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  27.27 
 
 
250 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  29.45 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  27.49 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  33.09 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  30.51 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  30.51 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  30.51 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  31.33 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  31.33 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  30.67 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  31.33 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  26.84 
 
 
485 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  28.28 
 
 
268 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  30.67 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  30.67 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  30.07 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.67 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1129  bacteriocin O-metyltransferase  30.67 
 
 
281 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1221  bacteriocin O-metyltransferase  30.07 
 
 
281 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  27.75 
 
 
276 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  30 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  25.27 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55206  macrocin o-methyltransferase domain-containing protein  26.79 
 
 
349 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  25.73 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  30 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45110  predicted protein  26.58 
 
 
345 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  29.09 
 
 
557 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.65 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  26.77 
 
 
266 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  30.49 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  30.83 
 
 
252 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.46 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  27.7 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  27.71 
 
 
286 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  26.71 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  30.22 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  25.71 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1954  putative O-methyltransferase  28.26 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  normal  0.0258663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  26.63 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  38.1 
 
 
143 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.67 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>