42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2468 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  57.14 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  49.26 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  41.18 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  45.45 
 
 		 227 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  36.69 
 
 		 434 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  36.09 
 
 		 434 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  32.88 
 
 		 382 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  33.81 
 
 		 218 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  33.67 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  27.4 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  33.86 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.67 
 
 		 882 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  31.07 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  32.03 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.53 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  29.41 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.73 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.73 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  30.56 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.73 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  27.87 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.57 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  35.48 
 
 		 143 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  27.39 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  32.67 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  29.24 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 485 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  28.28 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.33 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  28.87 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.38 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  31.01 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  29.3 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  29.45 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1954  putative O-methyltransferase  27.78 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  normal  0.0258663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  28 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>