37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  100 
 
 
143 aa  295  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  55.12 
 
 
273 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  42.24 
 
 
251 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  42.86 
 
 
240 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  43.09 
 
 
257 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  44.35 
 
 
257 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  39.66 
 
 
268 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  41.57 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.65 
 
 
276 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  34.41 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  36.96 
 
 
218 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  35.25 
 
 
282 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  35.48 
 
 
281 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
402 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  32.95 
 
 
261 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  32.54 
 
 
268 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  32.63 
 
 
642 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  30.09 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0375  hypothetical protein  37.31 
 
 
268 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  27 
 
 
273 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  30.95 
 
 
261 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  30.95 
 
 
261 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1855  glycosyltransferase-like protein  34.15 
 
 
258 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  42.42 
 
 
232 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.4 
 
 
224 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.4 
 
 
224 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.5 
 
 
246 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  30.77 
 
 
434 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  27.64 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.16 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  38.1 
 
 
227 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  30.95 
 
 
266 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  46.94 
 
 
213 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.8 
 
 
236 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2182  macrocin-O-methyltransferase  32.93 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.321151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>