23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3751 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  36.84 
 
 
257 aa  164  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  38.68 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  39.44 
 
 
273 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  33.06 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  32.52 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  32.52 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  40.3 
 
 
268 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.76 
 
 
251 aa  138  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  31.74 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.88 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.85 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  24.48 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.41 
 
 
143 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  22.28 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.91 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  31.67 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  26.63 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  29.34 
 
 
434 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  28.12 
 
 
434 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  26.32 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  24.34 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>