43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3365 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  30.1 
 
 
316 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  30.1 
 
 
324 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  20.87 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.53 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  26.92 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  27.75 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  24.09 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  31.22 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  23.72 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  32.28 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.87 
 
 
882 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  30.15 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  29.8 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  39.39 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.01 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  26.6 
 
 
382 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  23.23 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.29 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  24.62 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  25.65 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  24.19 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  27.78 
 
 
246 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.36 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  31.01 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  24.1 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  29.63 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  29.26 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25.91 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  25.25 
 
 
281 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  24.24 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  25.44 
 
 
277 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  24.34 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  24.88 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  25.25 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  25.25 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  25.25 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1954  putative O-methyltransferase  25.35 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  normal  0.0258663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  25.13 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  23.44 
 
 
485 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  25.14 
 
 
434 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1129  bacteriocin O-metyltransferase  24.75 
 
 
281 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>