24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4591 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  100 
 
 
158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  37.16 
 
 
265 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  32.08 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  32.61 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  28.93 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  39.39 
 
 
246 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  31.69 
 
 
324 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  23.87 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1129  bacteriocin O-metyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  38.37 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  25.37 
 
 
246 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  25.98 
 
 
281 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  22.78 
 
 
434 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  22.78 
 
 
434 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  26.77 
 
 
281 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  25.98 
 
 
281 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  25.76 
 
 
281 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  38.1 
 
 
232 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1221  bacteriocin O-metyltransferase  26.52 
 
 
281 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  25.98 
 
 
281 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>