18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0147 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  83.85 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  61.2 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  32.52 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  31.31 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.38 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.19 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25.93 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  24.29 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  22.17 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  24.53 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  30.95 
 
 		 143 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 485 aa  42  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  24.35 
 
 		 252 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>