27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3108 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.01 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  32.56 
 
 
276 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  31.03 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  28.44 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  26.03 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  30.77 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  22.11 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.04 
 
 
143 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  22.28 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  22.17 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  22.17 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  24.18 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  25.43 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.69 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  23.24 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  26.92 
 
 
252 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  27.93 
 
 
485 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  24.56 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  26.8 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  27.74 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  26.45 
 
 
557 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  25 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45110  predicted protein  25.35 
 
 
345 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  24.84 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>