More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0861 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  100 
 
 		 1160 aa  2407    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  34.28 
 
 		 1099 aa  513  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  33.75 
 
 		 1127 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 1086 aa  337  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  31.04 
 
 		 1052 aa  327  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  28.85 
 
 		 1051 aa  321  3.9999999999999996e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  29.92 
 
 		 1086 aa  317  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  28.2 
 
 		 1080 aa  283  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  26.48 
 
 		 1117 aa  249  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.27 
 
 		 1109 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.61 
 
 		 1125 aa  236  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 1131 aa  221  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.18 
 
 		 1122 aa  218  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  24.52 
 
 		 1016 aa  199  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 		 1128 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.98 
 
 		 1085 aa  172  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  23.62 
 
 		 1100 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  24.68 
 
 		 1086 aa  161  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  24.63 
 
 		 1124 aa  156  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 1143 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  22.99 
 
 		 1074 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  24.05 
 
 		 1067 aa  150  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  23.52 
 
 		 853 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  24.51 
 
 		 1083 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  24.8 
 
 		 1075 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  24.64 
 
 		 1075 aa  147  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  25.54 
 
 		 1081 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  24.53 
 
 		 1112 aa  145  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 1109 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  24.73 
 
 		 1140 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  25.07 
 
 		 1082 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  23.3 
 
 		 1075 aa  138  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  23.34 
 
 		 1089 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  24.33 
 
 		 1064 aa  134  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  25.09 
 
 		 1071 aa  127  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  23.55 
 
 		 1053 aa  125  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  21.75 
 
 		 1065 aa  124  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.28 
 
 		 1065 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  25.73 
 
 		 1153 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  25.95 
 
 		 696 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  27.38 
 
 		 1087 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  27.25 
 
 		 1090 aa  102  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  22.7 
 
 		 1078 aa  102  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  22.88 
 
 		 1069 aa  99.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  22.38 
 
 		 1153 aa  96.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  23.63 
 
 		 1077 aa  95.1  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  23.02 
 
 		 1060 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  22.79 
 
 		 1170 aa  93.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  23.64 
 
 		 1077 aa  89.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  26.15 
 
 		 1077 aa  89.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  24.82 
 
 		 1078 aa  87  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  38.24 
 
 		 774 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.78 
 
 		 1170 aa  83.2  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1160 aa  82.4  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  21.86 
 
 		 1072 aa  81.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  36.84 
 
 		 1172 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.23 
 
 		 1170 aa  81.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  29.29 
 
 		 1069 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  29.29 
 
 		 1069 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.02 
 
 		 1116 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  32.7 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.72 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.72 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  35.29 
 
 		 1194 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1065 aa  78.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.33 
 
 		 760 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.78 
 
 		 877 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  32.62 
 
 		 1131 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.85 
 
 		 1169 aa  76.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  36.75 
 
 		 1168 aa  76.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.85 
 
 		 1169 aa  76.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1137 aa  75.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.72 
 
 		 1212 aa  75.1  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  32.53 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  32.3 
 
 		 554 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  35.33 
 
 		 915 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  35.33 
 
 		 916 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1172 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.5 
 
 		 952 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  34.67 
 
 		 915 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  34.92 
 
 		 829 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 1147 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 		 906 aa  73.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  38.95 
 
 		 555 aa  73.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  41.11 
 
 		 560 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 669 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  33.57 
 
 		 1136 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  31.45 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  27.42 
 
 		 963 aa  72.4  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  40 
 
 		 560 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.4 
 
 		 805 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  40 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  40 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  29.03 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  40 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.6 
 
 		 962 aa  71.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 560 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  40 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  40 
 
 		 560 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.6 
 
 		 961 aa  71.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>