More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5769 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
778 aa  1568    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 
750 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  27.61 
 
 
763 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  28.07 
 
 
753 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.9 
 
 
739 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.49 
 
 
722 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.7 
 
 
736 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  27.27 
 
 
713 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 
742 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  24.97 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
741 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 
734 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  25.71 
 
 
801 aa  187  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  23.43 
 
 
743 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
760 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  25.22 
 
 
684 aa  170  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 
753 aa  157  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
751 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
751 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.78 
 
 
743 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 
727 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.79 
 
 
755 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.88 
 
 
779 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 
727 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.47 
 
 
797 aa  134  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
740 aa  134  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.7 
 
 
770 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  23.37 
 
 
780 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 
790 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.82 
 
 
806 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.5 
 
 
738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 
804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
478 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  21.69 
 
 
756 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
478 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.87 
 
 
795 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.08 
 
 
772 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.72 
 
 
802 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  24.64 
 
 
786 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.8 
 
 
739 aa  118  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.54 
 
 
722 aa  117  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.96 
 
 
872 aa  117  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.04 
 
 
721 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.82 
 
 
720 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  21.25 
 
 
745 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.43 
 
 
741 aa  115  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.53 
 
 
756 aa  114  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.28 
 
 
720 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.84 
 
 
731 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  28.57 
 
 
511 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  22.95 
 
 
734 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.69 
 
 
726 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
745 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  23.57 
 
 
624 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
474 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.4 
 
 
758 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.43 
 
 
727 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.86 
 
 
711 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  25.49 
 
 
492 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.59 
 
 
758 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.15 
 
 
464 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  25.76 
 
 
527 aa  103  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.12 
 
 
739 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0828  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
726 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.490846  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  21.99 
 
 
753 aa  100  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.99 
 
 
741 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
737 aa  99.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.08 
 
 
741 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.48 
 
 
741 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.48 
 
 
741 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.48 
 
 
741 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  21.18 
 
 
784 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.71 
 
 
815 aa  97.8  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  21.71 
 
 
820 aa  97.4  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 
790 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 
759 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  26.77 
 
 
239 aa  95.9  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  25.06 
 
 
527 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 
496 aa  94.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.48 
 
 
708 aa  94  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.75 
 
 
505 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  21.2 
 
 
740 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  22.41 
 
 
710 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.72 
 
 
746 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.64 
 
 
741 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  19.91 
 
 
775 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  23.98 
 
 
731 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.64 
 
 
741 aa  91.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  19.97 
 
 
815 aa  91.3  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.35 
 
 
235 aa  90.5  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  24.92 
 
 
469 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  21.76 
 
 
748 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  24.57 
 
 
721 aa  89.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  23.81 
 
 
819 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  22.76 
 
 
528 aa  88.6  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  20.24 
 
 
789 aa  88.6  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.15 
 
 
503 aa  88.2  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>