69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1534 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  99.37 
 
 		 478 aa  947    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 478 aa  954    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  42.09 
 
 		 753 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  32.37 
 
 		 763 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  29.22 
 
 		 801 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  31.25 
 
 		 739 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.77 
 
 		 760 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  26.58 
 
 		 741 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  26.92 
 
 		 743 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 778 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  27.03 
 
 		 713 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 751 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 750 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  25.64 
 
 		 684 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.13 
 
 		 742 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 740 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.8 
 
 		 736 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  20.86 
 
 		 722 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  21.15 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.49 
 
 		 734 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.85 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.54 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 686 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  20.65 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  20.58 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  20.41 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 		 530 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13861  hypothetical protein  21.96 
 
 		 780 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.832923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  19.39 
 
 		 510 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1702  Phage integrase  23.81 
 
 		 660 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  19.5 
 
 		 804 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 643 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  20.44 
 
 		 511 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  19.36 
 
 		 727 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  20.48 
 
 		 790 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  18.21 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  18.99 
 
 		 480 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  29.63 
 
 		 721 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  19.79 
 
 		 514 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  24.52 
 
 		 722 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  25.08 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  28.21 
 
 		 746 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  21.83 
 
 		 786 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  20 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  24.18 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.66 
 
 		 743 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  22.5 
 
 		 745 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  22.5 
 
 		 745 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.02 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.87 
 
 		 755 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  18.37 
 
 		 708 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  20.45 
 
 		 756 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  23.75 
 
 		 746 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.75 
 
 		 746 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  23.75 
 
 		 746 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  22.62 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 761 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 		 731 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.92 
 
 		 739 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 738 aa  43.5  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.79 
 
 		 739 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.5 
 
 		 746 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  23.38 
 
 		 730 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 519 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  24.58 
 
 		 733 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>