More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15081 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  100 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  73.94 
 
 		 307 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  72.13 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  72.31 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  41.43 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  46.28 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  44.13 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  44.44 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  41.91 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  38 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  38.87 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  38.94 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  39.34 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  37.29 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  39.62 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  40.55 
 
 		 291 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  41.3 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  38.64 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  41.71 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1237  tRNA pseudouridine synthase B  36.78 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.657883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  35.83 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  34.3 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  35.12 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  39.9 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  35.95 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2487  tRNA pseudouridine synthase B  38.14 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.447446  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1000  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  39.34 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  40.1 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  36.79 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  37.86 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1438  tRNA pseudouridine synthase B  33.48 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  40.1 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0998  tRNA pseudouridine synthase B  37.59 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  36.29 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  36.4 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1091  tRNA pseudouridine synthase B  34.59 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0150332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  36.95 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3558  tRNA pseudouridine synthase B  32.63 
 
 		 327 aa  155  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.567602  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  38.89 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  41.12 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0565  tRNA pseudouridine synthase B  38.39 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  37.97 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  36.14 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  35.2 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  30.79 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  32.04 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  40.09 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  30.07 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0701  tRNA pseudouridine synthase B  37.1 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0781617  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1598  tRNA pseudouridine synthase B  38.39 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00177839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  30.69 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3327  tRNA pseudouridine synthase B  37.95 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  38.08 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  37.74 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  34.65 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  38.1 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  33.86 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1447  tRNA pseudouridine synthase B  33.66 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000785982  normal  0.274975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11500  tRNA pseudouridine 55 synthase  30.84 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0558927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  31.13 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  38.46 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  36.32 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  36.41 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  36.57 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  36.19 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1331  tRNA pseudouridine synthase B  36.78 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1357  tRNA pseudouridine synthase B  36.78 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  40.29 
 
 		 303 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  35.65 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  37.71 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  37.08 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  35.55 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  35.24 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1125  tRNA pseudouridine synthase B  30.33 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  36.11 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  36.97 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  29.32 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  39.15 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  32.81 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  38.31 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  30.62 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.16 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  35.63 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  33.89 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  34.26 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  38.5 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  35.65 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>