More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3585 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  304  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  32.17 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  34.06 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  36.96 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.99 
 
 		 627 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 324 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  28.57 
 
 		 622 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.53 
 
 		 325 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 297 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  34.27 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.29 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  33.61 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.69 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.62 
 
 		 287 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.3 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.77 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.29 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.37 
 
 		 625 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.77 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.87 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.94 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 281 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.03 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 293 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.37 
 
 		 390 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.94 
 
 		 301 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.87 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.29 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.03 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.08 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  28.85 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3263  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214365 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.62 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  29.17 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  27.59 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  28.48 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.55 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.92 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.25 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.59 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  27.1 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  30.13 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  30.13 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.93 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  31.82 
 
 		 305 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  30.34 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  28.28 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.17 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26.71 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.78 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.89 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  30.59 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  28.19 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  32.03 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  29.66 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  30.07 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.73 
 
 		 294 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.46 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.43 
 
 		 297 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.41 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>