More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1597 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 
739 aa  1514    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.08 
 
 
720 aa  340  5.9999999999999996e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.05 
 
 
779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
737 aa  270  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.73 
 
 
722 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 
753 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.52 
 
 
756 aa  243  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.45 
 
 
745 aa  243  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 
721 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.39 
 
 
772 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 
755 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
731 aa  230  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.85 
 
 
743 aa  230  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.43 
 
 
756 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.9 
 
 
790 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
738 aa  220  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.87 
 
 
734 aa  218  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.11 
 
 
804 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.86 
 
 
737 aa  213  7e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 
734 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.64 
 
 
726 aa  210  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.49 
 
 
711 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.82 
 
 
736 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.82 
 
 
710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.54 
 
 
770 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.58 
 
 
806 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.03 
 
 
727 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.5 
 
 
774 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 
738 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.78 
 
 
763 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.15 
 
 
724 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.21 
 
 
756 aa  170  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  25.69 
 
 
815 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.17 
 
 
722 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.25 
 
 
797 aa  168  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  26.03 
 
 
727 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.8 
 
 
733 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.57 
 
 
720 aa  163  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  24.7 
 
 
766 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.72 
 
 
872 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.91 
 
 
464 aa  158  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.77 
 
 
820 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.95 
 
 
750 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.24 
 
 
750 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.74 
 
 
742 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  34.59 
 
 
521 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  22.49 
 
 
739 aa  153  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  31.06 
 
 
624 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.87 
 
 
746 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.22 
 
 
492 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  25.69 
 
 
527 aa  150  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.97 
 
 
741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.04 
 
 
739 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  21.93 
 
 
708 aa  149  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.04 
 
 
739 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.04 
 
 
739 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.04 
 
 
739 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.95 
 
 
741 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.46 
 
 
508 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.31 
 
 
529 aa  147  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.41 
 
 
741 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.4 
 
 
746 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.46 
 
 
736 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.86 
 
 
741 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.86 
 
 
482 aa  145  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.1 
 
 
741 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.87 
 
 
741 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 
741 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.87 
 
 
741 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
778 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  21.88 
 
 
784 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.15 
 
 
772 aa  144  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.51 
 
 
756 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  23.37 
 
 
802 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.98 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.57 
 
 
730 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.7 
 
 
575 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
740 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.56 
 
 
217 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.36 
 
 
726 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.17 
 
 
741 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  22.25 
 
 
753 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  23.29 
 
 
775 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.17 
 
 
741 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  30.96 
 
 
605 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.89 
 
 
739 aa  140  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  32.84 
 
 
490 aa  140  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.2 
 
 
492 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.96 
 
 
454 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  31.2 
 
 
505 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  32.5 
 
 
466 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.96 
 
 
463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  22.54 
 
 
767 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.42 
 
 
732 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  24.39 
 
 
776 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.92 
 
 
667 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.9 
 
 
795 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  33.92 
 
 
249 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  25.48 
 
 
736 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>